تقوم الأمانة العامة للمجلس التنفيذي بدور رئيسي في خدمة مصالح مجتمع الإمارة وتطوير الخدمات الحكومية وفق أعلى وأحدث المعايير، وذلك من خلال تنظيم وتنسيق مهام المجلس التنفيذي وتسيير أعماله بصورة سلسة وفاعلة وتحقيق الأهداف المرسومة لحكومة عجمان.
وللأمانة العامة دور أساسي في رسم السياسات العامّة وصياغة الاستراتيجيات المطوّرة واعتماد القرارات ومتابعة تنفيذها مع الجهات الحكومية، كما تدعم الأمانة العامة عملية رفع كفاءة وفاعلية العمل المؤسسي وتوحيد ومواءمة جهود الجهات الحكومية لتحقيق تطلعات الإمارة وطموحاتها وإسعاد مواطنيها والمقيمين على أرضها.